Adiunkt na Wydziale Wokalno-Aktorskim Akademii Muzycznej im. I. J. Paderewskiego w Poznaniu. Swoje umiejętności wokalne doskonaliła między innymi u P. Holden, J. Rappe, Ch. Hampe, R. Karczykowskiego i H. Łazarskiej. Koncertuje w Polsce i za granicą będąc gościem licznych międzynarodowych festiwali muzycznych. Współpracowała z wieloma cenionymi dyrygentami, m. in Ch. Hogwoodem, K. Petrenko, S. Macleodem, M. Gesterem, M. Pijarowskim, G. Nowakiem, T. Wojciechowskim, S. Stuligroszem, Ł. Borowiczem, J. Salwarowskim, M. Nałęczem-Niesiołowskim, E. Kusem, J. M. Florenzio Juniorem, M. Toporowskim, a także orkiestrami: Concerto Köln, Czech Virtuosi, Orkiestrami Filharmonii Poznańskiej, Lubelskiej, Kaliskiej, Bałtyckiej, Warmińsko-Mazurskiej, Szczecińskiej, Zielonogórskiej, Koszalińskiej, Polską Orkiestrą Radiową, Orkiestrą Kameralną Polskiego Radia Amadeus, WOB – Wrocławską Orkiestrą Barokową, OH! – Orkiestrą Historyczną, Capellą Cracoviensis oraz Arte Dei Suonatori.
Marzena Michałowska jest laureatką wielu nagród, m.in za najlepsze wykonanie arii J.S.Bacha w Ogólnopolskim Konkursie Wokalnym w Dusznikach Zdroju i pieśni Karola Szymanowskiego podczas Ogólnopolskiego Konkursu Polskiej Pieśni Artystycznej w Warszawie. W 2006 roku zdobyła III Nagrodę w Międzynarodowym Konkursie Wokalnym we Vrable. W dorobku fonograficznym ma 17 albumów płytowych. W 2008 roku płyta „Musica Sacromontana” z jej udziałem otrzymała statuetkę Fryderyka, natomiast w roku 2017 jej płyta z muzyką Amando Ivančica „Musica Claromontana vol. 58”, została nominowana do tej prestiżowej nagrody fonograficznej w kategorii – Muzyka dawna.